法律咨询：责任和协议

首先要明确，任何经营问题的主体都是公司。公司具有独立法人资格，如果不是滥用，所有经营期间发生的问题都应当由公司以其所有的财产独立承担责任，并不能追究到股东的责任。所以在正常经营期间，应该说你并没有多少实际的风险。
大学生创业基金是市政府出台的政策，具体的申请和实施要视规定而定。具体的要求这个你要自己回去查一下，主要是看是不是要求一定要实际参加经营，还有相关的罚则。不过既然你还是法人代表，公司应该还是符合规定的，但如果你退出，有可能会涉及到偿还当初的基金欠款的问题。这个要注意，如果你查下来确实是要还，而且还有一定的罚则的话，一定让你姐姐把这笔费用留出来，打到你帐上，否则人家只会来找你索要，毕竟你才是申请的主体。
所谓诈骗算不上，这个你可以安心。不过如果你自己不参与经营，又一直挂在公司里，就永远存在一个返还基金欠款的风险，建议你还是尽快解决。

首先，上网查明白大学生创业基金的具体实施规定。
其次，找姐姐商量参与经营或者尽快退出公司，完成变更登记。
再次，预留出应当偿还政府的钱款，否则日后很可能要你自己一个人承担偿还责任。
最后，这种抹不开面子借钱借物借身份的情况很多，结果很多都是既得罪了人，又承担了损失，现在你找姐姐谈是在家里心平气和，以后很可能就是在法院对簿公堂了。